Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VtnP29788 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
VtnP29788 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
VtnP29788 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VtnP29788 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VtnP29788 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms