Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms