Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01853 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01853 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01853 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01853 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01853 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01853 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01853 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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