Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms