Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Slc18a3O35304 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Slc18a3O35304 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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