Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc180J3QNE4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms