Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm6594J3QM43 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm6594J3QM43 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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