Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm20518E9Q548 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm20518E9Q548 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20518E9Q548 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20518E9Q548 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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