Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms