Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Srp54bE9PXC0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Srp54bE9PXC0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms