Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms