Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms