Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Prr29B1ARI9 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prr29B1ARI9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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