Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Atp8b5A3FIN4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Atp8b5A3FIN4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atp8b5A3FIN4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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