Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc163A2AGD7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms