Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Hdac5Q9Z2V6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Hdac5Q9Z2V6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Hdac5Q9Z2V6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Hdac5Q9Z2V6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdac5Q9Z2V6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms