Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hdac6Q9Z2V5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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