Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms