Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn13Q9Z0S4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn13Q9Z0S4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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