Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rad18Q9QXK2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms