Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms