Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gde1Q9JL56 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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