Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms