Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp29Q9ES63 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp29Q9ES63 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp29Q9ES63 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp29Q9ES63 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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