Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms