Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mrpl4Q9DCU6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms