Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 4930579M01Rik-201ENSMUST00000130943 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm45047-201ENSMUST00000207651 309 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm26590-201ENSMUST00000180857 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Riok3Q9DBU3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms