Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms