Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms