Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpl4Q9D8E6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms