Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4bQ9D8B3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp4bQ9D8B3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms