Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Cldn22Q9D7U6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn22Q9D7U6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn22Q9D7U6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms