Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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