Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp5Q9D7S9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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