Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms