Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9D2Q3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms