Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2cQ9D1C1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms