Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Susd3Q9D176 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Susd3Q9D176 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Susd3Q9D176 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms