Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms