Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mms19Q9D071 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Mms19Q9D071 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mms19Q9D071 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mms19Q9D071 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mms19Q9D071 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mms19Q9D071 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms