Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms