Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms