Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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RTRAFQ9CQE8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RTRAFQ9CQE8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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