Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CQC3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Q9CQC3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CQC3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CQC3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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