Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms