Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RtcbQ99LF4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms