Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Cldn16Q925N4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms