Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp3Q91W36 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Usp3Q91W36 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp3Q91W36 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Usp3Q91W36 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp3Q91W36 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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