Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccdc115Q8VE99 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccdc115Q8VE99 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccdc115Q8VE99 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccdc115Q8VE99 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccdc115Q8VE99 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms