Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OptnQ8K3K8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms